Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HLFQ16534 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLFQ16534 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLFQ16534 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLFQ16534 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLFQ16534 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLFQ16534 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLFQ16534 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLFQ16534 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HLFQ16534 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms