Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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