Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms