Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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