Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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RAB3GAP1Q15042 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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RAB3GAP1Q15042 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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