Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms