Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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