Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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