Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms