Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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