Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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