Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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