Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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