Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CBX3Q13185 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CBX3Q13185 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CBX3Q13185 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CBX3Q13185 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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