Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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