Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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