Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GRIK3Q13003 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GRIK3Q13003 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GRIK3Q13003 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GRIK3Q13003 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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