Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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