Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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