Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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