Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RASGEF1BQ0VAM2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RASGEF1BQ0VAM2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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