Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRSF4Q08170 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms