Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms