Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC100803.1-201ENST00000501440 1380 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms