Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms