Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms