Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms