Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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