Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO4P61968 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LMO4P61968 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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