Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB38P57729 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB38P57729 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms