Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms