Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BACE1P56817 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BACE1P56817 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms