Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BGRP55822 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms