Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLK1P49759 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms