Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms