Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSFMP43897 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms