Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms