Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTBRP36941 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTBRP36941 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTBRP36941 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBRP36941 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms