Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms