Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms