Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms