Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms