Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTX3P26022 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms