Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA1P25391 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms