Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms