Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPREP23469 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPREP23469 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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