Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTPRBP23467 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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