Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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GCSHP23434 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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GCSHP23434 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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GCSHP23434 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSHP23434 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSHP23434 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSHP23434 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSHP23434 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSHP23434 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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