Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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