Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC9A1P19634 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC9A1P19634 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms